• Construida sobre una ermita tardo-medieval.
• Edificada entre 1585 y 1587, se levantó la capilla lateral. Bajo la advocación de Ntra. Sra. de la Concepción. Trazada por Ginés Martínez de Aranda, constituye una de las partes más antiguas del conjunto.
• A comienzos del siglo XVII, se levantaría la nave central con un coro alto, capilla mayor y torre.
• La bóveda y coro de la iglesia, de forma diferente al esquema constructivo empleado con anterioridad, se erigen a finales del siglo XVII.
• Presenta una estructura peculiar al tener un patio blanqueado que da acceso a la iglesia.
• San Juan fue ayuda parroquial de la Abadía hasta mediados del siglo XIX, época en la que pasa a la iglesia del Rosario, abandonándose ésta casi por completo.
• Se venera al Cristo de la Salud, imagen de Martín Simón.
• A través de éste, aprovechando el vano del portón, todos los años, de forma ritual, en el primer domingo de septiembre y en Semana Santa, se levanta al Cristo de la Salud sobre las andas.

Museo de San Juan

• Levantado por la Hermandad del Cristo de la Salud, recoge gran cantidad de objetos, imágenes y publicaciones a cerca de la propia hermandad, el barrio y Alcalá la Real en general.
• El museo se compone de dos salas y del coro de la iglesia.