• La Capilla Mayor de la Catedral de Baeza, se encuentra en el testero entre la Capilla de los Quesada (Catedral de Baeza. Capilla de los Quesada) y la Capilla del Sagrario (Catedral de Baeza. Capilla del Sagrario).
• Con un gran retablo barroco del que se viene diciendo que fue tallado por Alonso Rosillo en 1619 y dorado por Manuel Pancorbo en 1741; sin embargo, en 1674 hay un asiento en Actas Capitulares Que dice: «Se acepta una planta trazada por el maestro de escultor y ensamblador Manuel del Alamo para el retablo mayor de la catedral de Baeza».
• Consta de dos cuerpos
• En los laterales del inferior, entre columnas salomónicas, dos hornacinas con dos notables tallas de San Pedro y San Pablo
• Sobre ellas discretas pinturas representando a San Jacobo y a San Eufrasio.
• En el centro, el manifestador con la urna que encierra los restos de San Pedro Pascual
• Encima, una hornacina con la llamada Virgen de los Mártires, imagen muy antigua, de material impreciso, que apareció en las célebres excavaciones de Baeza en 1633 y muy mixtificada por el aderezo que a continuación se le hizo.
• En el cuerpo superior, entre pilastras y columnas, la imagen de San Andrés.
• Ante el Altar Mayor se ha colocado una bella escultura de la Purísima, bien policromada, siglo XVI, que anteriormente estuvo en el trascoro.