- La mandó construir Don Diego de los Cobos, obispo de Jaén, iglesia-panteón del Hospital de Santiago.
- Se accede a ella desde el patio (Hospital de Santiago. Patio).
- En el eje de la puerta principal se levanta la Capilla - Panteón, a la que se accede por una imponente reja de tres puertas, diseñada por Vandelvira en 1573, siguiendo una modalidad propia de estos años de reja-puerta de gran solidez.
- El obispo Don Diego de los Cobos,
por último, dictaminó cómo debía ser el sepulcro, compuesto por una
cripta que se construyó en la capilla (donde permanece enterrado).
- Esta capilla ofrece gran originalidad debido a su planta en forma de H, con las dos torre desplazadas al centro del templo.
- El espacio abovedado queda conformado por dos grandes bóvedas vaídas, rodeadas de cañón. La decoración de las bóvedas es a base de elementos que siguen la ley de su forma geométrica, marcados por molduras: recuadros, casetones, círculos que albergan escenas pictóricas de pasajes bíblicos, virtudes, apóstoles, cartelas con inscripciones...
- Los muros aparecen desornamentados, lisos, probablemente para ser cubiertos con pinturas al fresco, como en las bóvedas.
- En un lateral hay una doble pared donde se encuentran los restos unos presos que fusilaron durante la guerra civil española.
- A los pies se sitúa el coro alto, siguiendo el modelo de iglesia de los Reyes Católicos.
- En el frontal del altar mayor actualmente hay una recomposición, a modo de retablo, con las tablas de la sillería del coro de esta capilla y de la de El Salvador.
- Desde ella se puede acceder a la Sacristía (Hospital de Santiago. Sacristía).